Bioinformatique : algorithmes et génomes

Description du cours

Dans ce cours, vous découvrirez comment l’informatique contribue à l’interprétation du «texte» des génomes.

Les différentes séquences de cours vous apporteront les connaissances nécessaires à la compréhension des entités et processus biologiques impliqués dans la génomique et proposeront conjointement une introduction à l’algorithmique sur les séquences de caractères qui, dans ce contexte, représentent l’information génétique.

Dans ce MOOC vous aurez également la possibilité de faire exécuter les algorithmes présentés et d’apprécier ainsi leur pertinence sur des données réelles. Si vous souhaitez aller plus loin, vous pourrez modifier ces programmes écrits en Python, voire en écrire de nouveaux et les tester.

Objectifs du cours

• Comprendre les concepts fondamentaux impliqués dans la génomique
• Acquérir des bases d'algorithmique en lien avec le traitement de l'information génétique

A qui s’adresse ce cours ?

Ce cours s’adresse à toute personne souhaitant découvrir l’analyse informatique de l’information génétique et acquérir les notions de base à l’interface de la génomique et de l’algorithmique.

Plan du cours

• Semaine 1 : ADN et séquences génomiques
• Semaine 2 : Gènes et protéines
• Semaine 3 : Prédiction des gènes
• Semaine 4 : Comparaison de séquences
• Semaine 5 : Arbres phylogénétiques

Équipe pédagogique

Auteurs :

• François Rechenmann, chercheur en bioinformatique, Inria.
• Thierry Parmentelat, ingénieur de recherche, Inria.

Accompagnement pédagogique :

• Christelle Mariais, ingénieure pédagogique, Inria Learning Lab.
• Isabelle Rey, ingénieure pédagogique, Inria Learning Lab.

Partenaires

Ce MOOC a été réalisé par Inria, en partenariat avec la fondation UNIT, dans le cadre du projet IDEFI uTOP - Université de Technologie Ouverte Pluri-partenaires - contrat PIA ANR-11-IDEFI-0037.